Hoe wordt de biodiversiteitsvoetafdruk gemeten?

De biodiversiteitsvoetafdruk wordt uitgedrukt in MSA-verlies in hectare. Dit wordt berekend aan de hand van de Mean Species Abundancy, oftewel hoe uitgebreid gebruikelijke soorten voorkomen in een bepaald gebied. Dit is een indicator voor de mate waarin biodiversiteit onaangetast is. Een MSA met een waarde van 1 betekent dat er geen verstoring heeft plaats gevonden, een waarde van 0 betekent dat de oorspronkelijke soorten op een stuk land zijn uitgestorven.

Het MSA-verlies wordt berekend als de landoppervlakte die beïnvloed wordt door de mens maal de daar geldende biodiversiteitswaarde (met andere woorden de biodiversiteitskwaliteit). Dit verlies wordt berekend over een tijdschaal van 100 jaar, zodat ook de toekomstige effecten van de huidige milieu-impacts worden meegenomen. Een verlies van 1 betekent niet dat 1 hectare compleet verwoest wordt in dat jaar, maar wel dat er natuur verloren gaat die overeenkomt met 1 hectare totaal verwoest land verspreid over de komende 100 jaar.